衍圣公被油炸的同一时间，位于曲阜的孔家大本营，也遭到了清算。
经过数天昼夜不停的赶路，近千名全副武装的锦衣卫，在指挥使许显纯率领下到达曲阜。
并以皇帝的圣旨，调动了登莱军镇一万兵马，配合缉拿孔氏之人及其同党，全部抄家灭族。
登莱巡抚袁可立和登莱军镇总兵官在接到调兵令时，都是在心里暗暗感慨皇帝的气魄。
他们这样的高官，对于京师的所发生的事情，是时刻关注着的，更不用说孔家之事早已传的沸沸扬扬。
如今调兵令已到，依照陛下以往的行事风格，此时此刻，孔胤植恐怕是早已人头落地。
袁可立对于皇帝如此的铁血手腕，可谓是又喜又怕。
喜的是，陛下真的是说到做到，不怕被诋毁，更不在意自己所谓的圣君名声，虽然过于血腥残酷，可大明朝已病入膏肓。
怕的是陛下如此对待孔家这样的千年世家，恐怕会引起极大的反弹。
大明朝终究是皇帝与士大夫共天下，不管是要办事还是要治理地方，都是需要他们来的。
而如今双方早已势同水火，大明朝的路是走向悬崖还是更高的山巅，实在无法预料。
但他身为坚定的保皇党，也深知一荣俱荣一损俱损的道理。
皇帝大权在握，他就能在高位实现自己的抱负。
如果皇帝倒了，到时他也不会有好下场。
想明白这些后，袁可立也算是豁出去了，当即表示要亲自督军随行，前往曲阜。
有着这一万训练有素的精兵，许显纯在山东的缉拿和抄家行动，进行的异常顺利。
经过近一个月的全方位大抄家后，整个曲阜孔氏，被一网打尽。
而与孔氏有着利益勾结的那些官员、士绅、地主，根本想不到灭顶之灾来的竟然如此之快。
在毫无预兆及装备的情况下，锦衣卫或是身披铁甲的军士就已将他们包围。
其中大大小小的官员竟然多达四十余人，而士绅地主之类的，则更不用说了，数不胜数。
事后许显纯按照名册统计，山东的地主豪绅直接少了三分之一。
人抓齐之后，许显纯也是心狠手辣，就在当地开始批量行刑，包括那些官员，都未经过三司会审，就已人头落地。
此次事件之后，大名鼎鼎的曲阜孔氏，彻底名存实亡，整个北孔一脉的人，全部进了阴曹地府。
朱由校多年的谋划，终于是有了结果，这个大毒瘤一除，朱由校心中可谓是千斤重担落下，轻松无比。
如今他连孔氏都能灭族，只要他牢牢的掌控住军队，大明朝已无任何势力能阻挡他的脚步。
当然，抄了这么多的家，收获自然也是前所未有的。
经过盘点统计，此番山东抄家之行，光是黄金就有一百七十二万两，白银五千四百万两，其余的纸钞通宝铜钱之类，实在太多，一时半会根本清点不完。
而他需要的粮米食盐等物，也是收货不菲，足足五百万石的米麦，是大明朝如今一年四分之一的税粮收入。
由此可见孔氏与这些士绅地主们究竟是多么富有。
怪不得历史上黄台吉如此热衷于入关打劫，而且每次必去山东，即使是部队损失惨重依然如此，换做是朱由校来，他也会这样做。
而土地田亩等固定资产，实在是太多了，没个一年半载的恐怕统计不完。
朱由校也不急，他先从全国各地重新挑选官员赴山东任职，先稳住地方衙门的正常运转，再好好的盘算统计。
同时也趁这个大好机会，在山东各个府城正式建立锦衣卫镇抚司，每个府城设镇抚使一人，北镇抚司缇骑一百，负责监督地方衙门以及统计抄家之事。
锦衣卫衙门也算是走出两京，在行省设立了正式机构，对于朱由校掌控地方的中央集权，至关重要。
除此之外，朱由校也开始完善北征事宜。
他先是令熊廷弼联系阿敏，告知他明军不久即北征辽东，让他准备好接应。
宣府大同的兵马，也早已集结完毕，包括从其他军镇调派的后勤部队，全部都以就位。
所需的粮草物资，朱由校则是先从自己的内帑中调取垫上，在这一个月的时间里，早已分批次的运送到宣府和大同。
而辽东方面，则早已准备就绪，朱由校早在去年就命顾秉谦和孙云鹤在辽阳建造了军储基地。
去年征收的三省秋粮，虽然没有把军储基地填满，但也足以供应大军所需的军粮了。
孔氏之事毕后，朱由校再一次将目光放回了京师。
此次他的动作有点大，朱由校又要长时间离开京师，因此他必须要确保朝廷中的主要官员和机构，都是自己的人。
首先就是担任了天启朝近三年内阁首辅的王象乾致仕，虽然他很多时候都站在自己的对立面，可对于这个四朝老臣，朱由校还是给予了他足够的体面。
内阁次辅徐光启，自然而然的接替了他的位置，王在晋接替徐光启，程国祥正式入阁。
六部尚书及侍郎，朱由校没有动，因为这些位置上大部分本就是他提拔上来的人，一些中立的官员朱由校也没有合适的人选进行替换。
军队以及警部，也正式确定了所属职责。
羽林近卫军作为自己的亲军，由皇帝亲自掌管，四大营的参将，位同军镇总兵官，直接对皇帝负责，负责征战事宜。
城防军则是由军部管理，勋贵担任提督，首任提督自然是勋贵中年轻一代的领军人物，张世泽。
毕竟英国公一家也是忠心耿耿，自己继位之初以及初建羽林军时，如果没有张维贤鼎力支持，不会这么顺利。
城防军的职责则是负责京师外城区域的防卫工作。
而内城由御林军负责，到时马祥麟这个统领自然也是要随战出征的，因此这个留守京师的人选，朱由校这段时间一直拿捏不定。
勋贵已经掌握了警部和军部的话语权及兵权，这御林军自然是不能再让他们沾染的。
文官就更不用说了，京师的这三支军队，他费尽心思才把军权拿回来，是绝对不会再让他们有可乘之机的。