经济上，朱棣支持农商；鼓励发展生产。
靖难之役后，眼见‘淮北鞠为茂草’大批农民流离失所；为鼓励复耕恢复民生，朱棣数次蠲免赋税：下令山东、北平、河南遭受战祸的州县，但凡无法耕种的百姓；皆免去三年差税。不曾遭受祸乱的地方，也与直隶凤阳、淮安、徐州、滁州、扬州一同蠲免秋夏税粮！其余直隶府州、山西、陕西、浙江、福建、江西、湖广、两广、四川、云南各蠲免一半，建文四年七月初一日以前拖欠的一应钱粮、盐课等一概免除。并命人兴修水利，疏通运河......多措并举之下，由于生产得到了极大恢复；全国税收连续三年保持在三千一百万石以上。尤其是永乐三年（1405年），当年税粮更是达到了石之巨！此外，军卫屯田的收入也与日俱增；高峰时一度突破了二千三百万石。
同时为支持百业发展，启发民智；即位之初，朱棣便下令恢复了此前被废的学校并命人搜集整理了大量秘典文献备用。此书由解缙等人负责编修，过程召集147人，首次成书于永乐三年，初名《文献大成》但朱棣审阅后，认为‘所篆尚多未备’不甚满意。于是永乐三年，再命太子少师姚广孝（道衍）、解缙、礼部尚书郑赐监修以及刘季篪等人重修，动用朝野上下共2169人编写；并组织设置监修、总裁、副总裁、都总裁等职，以负责各级编撰日常。同时特准其参用文渊阁所有藏书。数千人呕心沥血之下，于永乐五年（1407年）再次定稿进呈。
全书正文卷，装成册，约3.7亿字；书中保存了上自先秦、宋元以后的轶文秘典，下讫明初各种典籍达8000余种；包括经、史、子集、释庄、道经、戏剧、平话、工技、农艺、医卜、文学等内容，可说是经天法地包罗万有！朱棣看后十分满意，不但亲自作序一篇；而且还将该书命名为《永乐大典》此时距十八世纪中叶出版的《大英百科全书》与《法国百科全书》，足足早了三百余年......
由于书中涵盖了各种专业指导，是以此书一经发行；在助推各行各业飞速发展的同时，也使帝国达到了空前鼎盛繁荣！其间，不但人口数量得到了较快增长；而且冶铁、造船、手工业也得到了极大发展。尤其是造船技艺，不但开创历史先河；而且船只种类也多不胜数.....
.与此同时，军事方面；朱棣也从不敢懈怠，始终致力于革故除弊开拓疆土。由于深知分封制度遗患无穷，即位之初；朱棣变下令取消藩王护卫，并为靖难功臣大举加官进爵。同时设立‘东厂’与锦衣卫实行厂卫并行；以强化皇权。并将大部分驻于南京的京卫调去北方，同时提升某些北方军队为亲军。然后在此基础上组建‘五军营’‘三千营’‘神机营’三大营，使其绝对效忠皇帝；成为帝国最为精锐的堡垒中坚！有了这支最为强大的军队在手，此后的数次出征之中；朱棣也确实令行禁止斩获颇丰。
永乐初年，朱棣派遣义子安定王后裔脱脱空降哈密，设哈密卫，以畏兀儿马、哈马火者为指挥，辜思诚、哈只马哈麻为经历，周安为忠顺王长史、刘行为纪善；以迎护朝使，统领诸藩，屏蔽西陲。
永乐四年（1406年）出兵收复安南（今越南），永乐五年与河内置交趾布政司（行省）下设十五府、三十六州、两百余县；以对其进行直接统治。
永乐七年（1409年），明朝在黑龙江下游东岸特林地方，设立了奴儿干都司，管辖今黑龙江、马苏里江、松花江流域与库页岛等地。