A.d.3029，星际战争僵持不下，地表突然出现大量的射线，幸存下来的人类称之为“巨变”，而“巨变”发生之前的时代，被掩体人称作“地表时代”。
在“巨变”发生时，人类脆弱的身体，不堪一击，大多数人类消失了，但在地下掩体中的人类存活了下来，掩体是人类进行太空探索和地心探索的同时，兴建于地壳中的巨大空间，掩体距离地表平均距离七千米，有效的阻挡了存在于地表的辐射，虽然没有足够的设备和能源支持这部分掩体人类回到地面，他们仍然依靠地下现有的设备维持还算不错的生存水平。而在地表，极少数顽强的人类在巨变中存活了下来，并且大部分适应了巨变在地表带来的可怕后果，他们利用70亿人类留下的几乎覆盖了地球表面基数巨大的工业与智能设备，弥补了人数不足的缺陷，他们继承了全人类70%-80%的工业科技和基础设施，继续统治这个星球，虽然这颗星球已面目全非。
“巨变”发生后，一百余年间没有外星人再到达这颗荒废的星球，也没有人知道这颗星球的内部，还生存着大量的人类。
只要留下火种，总有一天会变成燎原烈火，随着时间的推移，地表残存的人类也已经继续繁衍生息，渐渐形成了各种团体与部落，踏上了重建文明之路；而掩体中，人们常年不见天日，甚至很多人已经不知道自己实际上是来自于地表，毫无目的的生存在掩体中，在缺少阳光这种充沛的能量的情况下，掩体中的生存，也变得日趋艰难。
地表人类在发现通往掩体的“井道”之后，高大的地表人类便通过找寻井道，深入掩体，掠夺掩体中地表时代遗留下的设备设施，掩体人类为了防止地表人类的入侵，对所有已发现的井道进行了封堵，而拥有外骨骼装甲身体强大的地表人类，不时突破掩体人类的防御……
人类从原本拥有强大的太空远航能力变成了地表和掩体的争斗，而早期由人类分支形成的拉特星人也开始蠢蠢欲动，想要趁地表文明重建之前，占领这颗古老的星球……